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专家解码中疾控公布的基因组序列:北京新发地病毒为输入性

原标题:中国疾病预防控制中心在专家解码中公布的基因组序列:北京新发地病毒是进口的 北京的疫情已经恢复。病毒到底来自哪里?它什么时候会被介绍到北京?经过病毒专家们…

原标题:中国疾病预防控制中心在专家解码中公布的基因组序列:北京新发地病毒是进口的

北京的疫情已经恢复。病毒到底来自哪里?它什么时候会被介绍到北京?经过病毒专家们日以继夜的战斗,科学家们得出了一个初步的结论:这是一种进口病毒。

6月18日晚,中国疾病预防控制中心通过“新型冠状病毒国家科技资源服务系统”于2020年6月正式发布了北京新发地市场最新疫情及病毒基因组序列数据。

这三个数据来自北京确诊病例的基因组序列数据(NMDC60013902-01、NMDC60013903-02)和环境样品的基因组序列数据(NMDC60013903-03)。

中国疾病控制和预防中心向世界卫生组织和全球共享流感数据倡议提交了最新流行和病毒基因组序列数据,以便与国际社会共享。

“从这三种病毒的基因组序列来看,这是新的冠状病毒D614G突变,它并不比欧洲型更古老。从基因库来看,第一个样本是1月28日在德国收集的。发现了突变,但比例很低。截至5月,D614G的比例非常高。在吉赛德的数据库中,这次从北京收集的最新数据是4月21日的样本,这也是菌株。”一位病毒遗传学家告诉第一财经。

“它肯定是进口的,因为中国大陆以前没有D614G突变株。D614G是新冠状病毒的一个非常大的亚型。这三个基因组序列有一些新的特征。除了欧洲和中国台湾,还有一个序列,南美洲的哥伦比亚也有一个。因此,它是否必须来自欧洲仍然需要仔细考虑。其次,很难判断他是两三个月前进入中国的。”一位生物专家也同意上述病毒遗传学家观点,并向第一财经部表达了同样的观点。

6月18日晚,中国疾病预防控制中心通过“新型冠状病毒国家科技资源服务系统”于2020年6月正式发布了北京新发地市场最新疫情及病毒基因组序列数据。

北京新皇冠病毒是D614G突变株

那么,新的冠状病毒D614G突变到底是什么?这需要从新冠状病毒的S蛋白开始。

s蛋白,也称为“尖峰糖蛋白”,位于新冠状病毒的最外层,像突出的“皇冠”,是新冠状病毒侵入人体细胞的武器,即病毒粘附并感染人体细胞的关键部位。

新冠状病毒的D614G突变是指S蛋白的氨基酸614从天冬氨酸(D)变为甘氨酸(G)。因此,有些人也称突变菌株G614和旧菌株D614。

与D614蛋白相比,D614蛋白发生了结构变化,这种菌株仅在欧洲和北美发现。

在短短几个月内,D614G已经成为世界主流病毒株。科学家发现,这种突变菌株的比例从年初的0增加到3月份的26%,4月份的65%,5月份的70%。研究人员认为,这表明突变菌株D614比旧菌株D614具有更多的传播优势。

“根据病毒的进化史,在适应人体变异的过程中,病毒往往具有高度传染性和弱致病性。也就是说,病人将遭受更轻微的疾病和不太严重的疾病。目前,D614G突变的强传染性已被科学实验证明。是否轻微仍需临床观察。”病毒遗传学家说。

为了确定D614G突变的特征,斯克里普斯研究所的Choe和Farzan领导的研究小组评估了D614G在新冠状病毒进入细胞中的作用,发现G614感染hACE2-293T细胞的效率比D614高约9倍。

Choe和Farzan的团队还发现D614G突变增加了具有完整病毒表面功能的s蛋白的数量,从而增加了病毒与细胞结合的机会,提高了感染效率。

北京新发现的病毒基本上可以被鉴定为输入性病毒。

6月15日,中国疾病预防控制中心首席流行病学家吴尊友表示,此次疫情肯定不是在北京的主要地区,而是从外部传入的。

他还指出,该病毒的序列更类似于在欧洲广泛传播的病毒,但这并不意味着该病毒必须来自欧洲国家,需要收集进一步的信息来帮助判断。

GISAID数据库发布了元信息,如新冠状病毒的名称、采样日期、采样地点、提供样本的单位、提交数据的单位等。专家从这些信息中发现,北京新冠状病毒的基因组序列与捷克共和国、台湾、丹麦、哥伦比亚、以色列和奥地利的非常接近。

然而,它到底起源于哪里?它是什么时候被介绍到北京的?目前,还没有定论。

既然D614G突变株不是中国大陆本地病毒,它是如何输入北京的?

“从国外进口的病例可能会将病毒带到市场上,但从中国疾病预防控制中心公布的样本检测来看,可能存在污染源。”一位流行病学家说。

中国疾病预防控制中心研究员吴在接受媒体采访时表示,中国疾病预防控制中心已经发现许多新的冠状病毒核酸阳性样本,包括海产品商店和沟渠等环境样本。\”整个环境仍然被病毒严重污染。\”

与此同时,吴提到了的一个样本,即“整条鲑鱼的口腔拭子”检测到了核酸阳性的新冠状病毒。这一发现为病毒的起源提供了一个新的方向:鲑鱼口中的病毒在冷冻前被病毒污染了吗?还是在后来的解冻中被污染了?这还需要进一步的科学研究。

然而,无论如何,在北京新发现的病毒是来自通过冷链运输到市场的受污染的海鲜或肉制品,还是因为受感染的人进入市场而传播?还没有结论。

责任编辑:吴

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